AT1G57750.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.766 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 96, subfamily A, polypeptide 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a CYP96A15, midchain alkane hydroxylase, involved in cuticular wax biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 96, subfamily A, polypeptide 15 (CYP96A15); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 96, subfamily A, polypeptide 3 (TAIR:AT1G65340.1); Has 29548 Blast hits to 29460 proteins in 1520 species: Archae - 47; Bacteria - 3050; Metazoa - 10477; Fungi - 6558; Plants - 8176; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1237 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:21384186..21385679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57699.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 497 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMLGFYVTF IFFLVCLFTY FFLQKKPQGQ PILKNWPFLR MLPGMLHQIP RIYDWTVEVL EATNLTFYFK GPWLSGTDML FTADPRNIHH ILSSNFGNYP 101: KGPEFKKIFD VLGEGILTVD FELWEEMRKS NHALFHNQDF IELSVSSNKS KLKEGLVPFL DNAAQKNIII ELQDVFQRFM FDTSSILMTG YDPMSLSIEM 201: LEVEFGEAAD IGEEAIYYRH FKPVILWRLQ NWIGIGLERK MRTALATVNR MFAKIISSRR KEEISRAKTE PYSKDALTYY MNVDTSKYKL LKPNKDKFIR 301: DVIFSLVLAG RDTTSSVLTW FFWLLSKHPQ VMAKLRHEIN TKFDNEDLEK LVYLHAALSE SMRLYPPLPF NHKSPAKPDV LPSGHKVDAN SKIVICIYAL 401: GRMRSVWGED ALDFKPERWI SDNGGLRHEP SYKFMAFNSG PRTCLGKNLA LLQMKMVALE IIRNYDFKVI EGHKVEPIPS ILLRMKHGLK VTVTKKI |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)