AT1G29965.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein L18ae/LX family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein L18ae/LX family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation, ribosome biogenesis; LOCATED IN: ribosome, cytosolic large ribosomal subunit; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L18ae/LX (InterPro:IPR021138), Ribosomal protein L18ae (InterPro:IPR002670); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: 60S ribosomal protein L18A-1 (TAIR:AT1G29970.2); Has 759 Blast hits to 757 proteins in 282 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 315; Fungi - 159; Plants - 155; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 130 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:10498458..10499373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21285.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 178 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSVIRLHQYQ VVGRALPTEK DEQPKIYRMK LWATNEVLAK SKFWYYLRRQ KKVKKSNGQM LAINEIFEKN PTTIKNFGIW LRYQSRTGYH NMYKEYRDTT 101: LNGAVEQMYT EMASRHRVRF PCIQIIKTAT VPASLCKRES TKQFHNSKIK FPLVFRKVRP PTRKLKTTFK ANKPNLFM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)