AT4G28670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase family protein with domain of unknown function (DUF26) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: sperm cell, male gametophyte, pollen tube; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 2 (TAIR:AT1G70520.1); Has 117021 Blast hits to 115588 proteins in 4482 species: Archae - 87; Bacteria - 12256; Metazoa - 43536; Fungi - 10005; Plants - 33534; Viruses - 536; Other Eukaryotes - 17067 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:14151387..14153935 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 70185.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 625 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASTLISSLA VVLPLTLLAP SMSMKISRID VLGYICNNGT VSNEEAYRRS YQINLDAIRG DMRHVKFGTH EHGDPPERMY VLSQCVSDLS SDECSLCWSR 101: ATDLLSQCFP ATGGWFHLDG CFVRADNYSF YQEPVSHQDT KICASDKEKS AEFKGLVKEV TKSIVEAAPY SRGFSVAKMG IRDLTVYGLG VCWRTLNDEL 201: CKLCLADGAL SVTSCLPSKE GFALNAGCYL RYSNYTFYNE RGLLAMSFTK ENLTYIFVIS MVGVLAIAAG FWCGKCFYMR TSPKKKIKGT KTKKFHLFGH 301: LRIEKESESI CTESHLMSFE YSTLKKATNN FNESCKLGVG GYGEVFKGTL SDGREIAIKR LHVSGKKPRD EIHNEIDVIS RCQHKNLVRL LGCCFTNMNS 401: FIVYEFLANT SLDHILFNPE KKKELDWKKR RTIILGTAEG LEYLHETCKI IHRDIKASNI LLDLKYKPKI SDFGLAKFYP EGGKDIPASS LSPSSIAGTL 501: GYMAPEYISK GRLSNKIDAY SFGVLVLEIT SGFRNNKFRS DNSLETLVTQ VWKCFASNKM EEMIDKDMGE DTDKQEMKRV MQIGLLCTQE SPQLRPTMSK 601: VIQMVSSTDI VLPTPTKPPF LHDSM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)