AT1G68460.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : isopentenyltransferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a putative adenylate isopentenyltransferase. It catalyzes the formation of isopentenyladenosine 5'-monophosphate (iPMP) from AMP and dimethylallylpyrophosphate (DMAPP), but it has a lower Km for ADP and likely works using ADP or ATP in plants. It is involved in cytokinin biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
isopentenyltransferase 1 (IPT1); FUNCTIONS IN: AMP dimethylallyltransferase activity, ATP/ADP dimethylallyltransferase activity; INVOLVED IN: cytokinin biosynthetic process, secondary growth; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 6 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, C globular stage, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: tRNA isopentenyltransferase (InterPro:IPR002627); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATP/ADP isopentenyltransferases (TAIR:AT3G19160.1); Has 7944 Blast hits to 7761 proteins in 2606 species: Archae - 0; Bacteria - 5388; Metazoa - 167; Fungi - 152; Plants - 293; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1944 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:25668976..25670049 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40766.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 357 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTELNFHLLP IISDRFTTTT TTSPSFSSHS SSSSSLLSFT KRRRKHQPLV SSIRMEQSRS RNRKDKVVVI LGATGAGKSR LSVDLATRFP SEIINSDKIQ 101: VYEGLEITTN QITLQDRRGV PHHLLGVINP EHGELTAGEF RSAASNVVKE ITSRQKVPII AGGSNSFVHA LLAQRFDPKF DPFSSGSCLI SSDLRYECCF 201: IWVDVSETVL YEYLLRRVDE MMDSGMFEEL SRFYDPVKSG LETRFGIRKA IGVPEFDGYF KEYPPEKKMI KWDALRKAAY DKAVDDIKRN TWTLAKRQVK 301: KIEMLKDAGW EIERVDATAS FKAVMMKSSS EKKWRENWEE QVLEPSVKIV KRHLVQN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)