AT1G63370.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.971 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Flavin-binding monooxygenase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Flavin-binding monooxygenase family protein; FUNCTIONS IN: NADP or NADPH binding, monooxygenase activity, FAD binding, flavin-containing monooxygenase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Flavin-containing monooxygenase FMO (InterPro:IPR000960), Flavin-containing monooxygenase-like (InterPro:IPR020946); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Flavin-binding monooxygenase family protein (TAIR:AT1G62620.1); Has 15703 Blast hits to 15250 proteins in 1953 species: Archae - 123; Bacteria - 8779; Metazoa - 1173; Fungi - 1469; Plants - 810; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3349 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:23503205..23505358 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51241.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 450 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPALSPTRS HHVAVIGAGP AGLVAARELR REGHSVVVFE KQKQVGGTWI YTDEVESDPL SVDPTRSVVH SSVYRSLRIN GTRECTGYRD FPFVVRSGVS 101: RDRRRFPSHG EVLAYLKDFA KEFGIEEMVR FETEVVKVSP AAEEGIGKWR IESTEKEKKV RRDEIYDAVV VCNGHYVEPR LAQIPGISSW PGKEMHSHNY 201: RIPEPFRDKV AVLIGNSSSA EDISRDIARV AKEVHVACRS NPADTFIKQT GYNNLWTHSM IESVHEDGSV VYQNGKTISV DIIMHCTGYK YHFPFLDTNG 301: IVTVDDNRVG PLYKDVFPPA FAPWLSFIGI PWQVLPFPMF ELQSKWIAGV LSGRIPLPSK EDMMIEIKTF YSTLEVQGIP KRYTHRMGNT QFEYDNWLAS 401: QCGCSETEEW RKEMCLANGV RKEAHPETYR DEWDDHHLVS EAYQDFSLYS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)