AT1G14110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.817 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : fucosyltransferase 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of xyloglucan fucosyltransferase family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
fucosyltransferase 9 (FUT9); FUNCTIONS IN: fucosyltransferase activity; INVOLVED IN: cell wall biogenesis; LOCATED IN: endomembrane system, membrane; EXPRESSED IN: stem, cauline leaf; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Xyloglucan fucosyltransferase (InterPro:IPR004938); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fucosyltransferase 8 (TAIR:AT1G14100.1); Has 330 Blast hits to 321 proteins in 17 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 328; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:4830297..4831915 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54478.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 474 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIKLTIAIAT CLVLCLVLLL PSSNISYRHK YDLPTNGLND SEQQSEKLLG GLLATGFEEK SCLSRYDQSM SKPSPYKPSR HIVSKLRSYE MLHKRCGPGT 101: KAYKRATKQL GHNELSSSGD ECRYVVWMPM FGLGNRMLSL VSVFLYALLT DRVMLVDQRN DITDLFCEPF PETSWLLPLD FPLNDQLDSF NREHSRCYGT 201: MLKNHGINST SIIPSHLYLD IFHDSRDHDK KFFCEEDQAF LDKVTWLVVK SNLYFVPSLW MIPSFQTKLI KLFPQKETVF HHLARYLFHP TNQVWGMVTR 301: SYNAYLSRAD ERLGIQVRVF SKPVGYFQHV MDQILYSDHL KNMFLEQASS TGETIEVYQP SGEKIQQTDK KLHDQKALAE IYLLSLTDEL VTSTRSTFGY 401: VAQGLGGLKP WILYEPRDKK TPNPPCVRAM SMEPCFLRAP LHGCQAKTIK IPPFVRICED WKTGLKLVDV SDEL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)