ATMG01190.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP synthase subunit 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
ATPase subunit 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATP synthase subunit 1 (ATP1); FUNCTIONS IN: copper ion binding, cobalt ion binding, zinc ion binding; INVOLVED IN: response to oxidative stress; LOCATED IN: mitochondrion, cell wall; EXPRESSED IN: cotyledon, guard cell, seed, leaf; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, alpha/beta subunit, nucleotide-binding domain, active site (InterPro:IPR020003), ATPase, F1 complex, alpha subunit (InterPro:IPR005294), ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, C-terminal (InterPro:IPR000793), ATPase, F1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal (InterPro:IPR018118), ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal (InterPro:IPR004100), ATPase, alpha/beta subunit, nucleotide-binding domain (InterPro:IPR000194); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATPase, F1 complex, alpha subunit protein (TAIR:AT2G07698.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chrM:-:302166..303689 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54974.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 507 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELSPRAAEL TNLFESRIRN FYANFQVDEI GRVVSVGDGI AQVYGLNEIQ AGEMVLFANG VKGMALNLEN ENVGIVVFGG DTAIKEGDLV KRTGSIVDVP 101: AGKAMLGRVV DAMGVPIDGK GALSDHEQRR VEVKAPGILE RKSVHEPMQT GLKAVDSLVP IGRGQRELLI GGRQTGKTTI AIDTILNQKQ INSRATSESE 201: TMYCVYVAIG QKRSTVGQLI QTLEEANALE YSILVAATAS DPAPLQFLAP YSGCAMGEYF RDNGMHALII YDDLSKQAVA YRQMSLLLRR PPGREAFPGD 301: VFYLHSRLLE RAAKRSDQTG AGSLTALPVI ETQAGDVSAY IPTNVISITD GQICLETELF YRGIRPAINV GLSVSRVGSA AQLKAMKQVC GSSKLELAQY 401: REVAAFAQFG SDLDAATQAL LNRGARLTEV PKQPQYAPLP IEKQILVIYA AVNGFCDRMP LDRISQYEKA IPNSVKPELL QALKGGLTNE RKMEPDAFLK 501: ERALALI |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)