ATMG00980.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein S12/S23 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
ribosomal protein L2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
RPSL2; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: mitochondrial large ribosomal subunit; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S12/S23 (InterPro:IPR006032), Nucleic acid-binding, OB-fold (InterPro:IPR012340), Nucleic acid-binding, OB-fold-like (InterPro:IPR016027), Ribosomal protein S12, bacterial-type (InterPro:IPR005679); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein S12/S23 family protein (TAIR:AT2G07675.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrM:-:260224..260601 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14078.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 125 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPTFNQLIRH GREEKRRTDR TRALDKCPQK TGVCPRVSTR TPKKPNSAPR KIAKVRLSNR HDIFAHIPGE GHNSQEHSTV LIRGGRVKDS PGVKSHCIRG 101: VKDLMGIPGR RRGRSKYGAE KPKSI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)