ATMG00810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DNA/RNA polymerases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
hypothetical protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
DNA/RNA polymerases superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Reverse transcriptase, RNA-dependent DNA polymerase (InterPro:IPR013103); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 (TAIR:AT4G23160.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrM:-:227709..228431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26777.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 240 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MYLLLYVDDI LLTGSSNTLL NMLIFQLSST FSMKDLGPVH YFLGIQIKTH PSGLFLSQTK YAEQILNNAG MLDCKPMSTP LPLKLNSSVS TAKYPDPSDF 101: RSIVGALQYL TLTRPDISYA VNIVCQRMHE PTLADFDLLK RVLRYVKGTI FHGLYIHKNS KLNVQAFCDS DWAGCTSTRR STTGFCTFLG CNIISWSAKR 201: QPTVSRSSTE TEYRALALTA AELTWSSASR SRDPSAMNTN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)