ATMG00730.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome c oxidase subunit 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes cytochrome c oxidase subunit 3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome c oxidase subunit 3 (COX3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome c oxidase, subunit III (InterPro:IPR000298); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cytochrome c oxidase, subunit III (TAIR:AT2G07687.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrM:+:218280..219077 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29744.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 265 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIESQRHSYH LVDPSPWPIS GSLGALATTV GGVMYMHPFQ GGARLLSLGL IFILYTMFVW WRDVLRESTL EGHHTKVVQL GPRYGSILFI VSEVMFFFAF 101: FWASSHSSLA PAVEIGGIWP PKGIEVLDPW EIPFLNTPIL PSSGAAVTWA HHAILAGKEK RAVYALVATV LLALVFTGFQ GMEYYQAPFT ISDSIYGSTF 201: FLATGFHGFH VIIGTLFLII CGIRQYLGHL TKEHHVGFEA AAWYWHFVDV VWLFLFVSIY WWGGI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)