ATMG00590.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : Cytochrome b/b6 protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
hypothetical protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
Cytochrome b/b6 protein; INVOLVED IN: respiratory electron transport chain; LOCATED IN: membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome b/b6 (InterPro:IPR016175); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cytochrome b/b6 protein (TAIR:AT2G07718.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chrM:+:169796..170737 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 35539.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 7.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 313 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTIRNQRFSL LKQPISSTLN QHLVDYPTPS NLSYWWGFGP LAGTMILSVL SSPALVSGLM VARAKNLVHS VLFPIPIFFS INQLFHYFCR LPIIKHLATK 101: CQLLLFLISH FLLLLVLTKL VLDLGGYLFM DDLSRALSQF VPGFSGGLGG GSNTPPNPSG DFFLSSYQTS DPDYHDQRRG DSYFSSAPGV QETHRHASGS 201: STNLHLNLND QSQDPIFLEV ERLSLKCDKV KEKTILKTQS LLLERGYHIP DERDIERAIN VVMTEHETID IDRRRKRFYY LYSCLGKTGN KFWMELLETL 301: ADYNINIKSD SDN |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)