ATMG00370.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Ycf1 protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
hypothetical protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Ycf1 protein; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ycf1 (InterPro:IPR008896); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ycf1 protein (TAIR:AT2G07739.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chrM:-:104954..105553 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23178.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 199 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVFQSFILGN LVYLCMKIIN SVVVVGLYYG FLTTFSIGPS YLFLLRARVM DEGEEGTEKK VSATTGFIAG QLMMFISIYY APLHLALGRP HTITVLALPY 101: LLFHFFFWNN HKHFFDYGST TRNEMRNLRI QCVFPNNLIF KLFNHLILPS SMLARLVNIY MFRCNNKMLF VTSSFVVCVR MLLVEWAFPL FQLFLVMKV |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)