ATCG01090.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NADPH dehydrogenases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes subunit of the chloroplast NAD(P)H dehydrogenase complex | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NDHI; FUNCTIONS IN: NADPH dehydrogenase activity; INVOLVED IN: photosynthesis; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NADH-plastoquinone oxidoreductase, subunit I (InterPro:IPR004497), 4Fe-4S binding domain (InterPro:IPR001450), NADH-quinone oxidoreductase, chain I (InterPro:IPR010226), 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site (InterPro:IPR017900), 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulpur binding domain (InterPro:IPR017896), Alpha-helical ferredoxin (InterPro:IPR009051); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Alpha-helical ferredoxin (TAIR:AT1G16700.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrC:-:119244..119762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20087.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 172 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLPMITGFMN YGQQTLRAAR YIGQGFMITL SHTNRLPVTI QYPYEKLITS ERFRGRIHFE FDKCIACEVC VRVCPIDLPV VDWKLETNIR KKRLLNYSID 101: FGICIFCGNC VEYCPTNCLS MTEEYEFSTY DRHELNYNQI ALGRLPMSVI DDYTIRTIWN SPQTKNGVNP LI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)