ATCG01050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NADH-Ubiquinone/plastoquinone (complex I) protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Represents a plastid-encoded subunit of a NAD(P)H dehydrogenase complex. Its mRNA is edited at four positions. Translation data is not available for this gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NDHD; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, acting on NADH or NADPH; INVOLVED IN: oxidation reduction, ATP synthesis coupled electron transport; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NADH-quinone oxidoreductase, chain M (InterPro:IPR010227), NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase (InterPro:IPR001750), NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain 4 (InterPro:IPR003918); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NADH dehydrogenase subunit 4 (TAIR:ATMG00580.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrC:-:115665..117185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56924.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 506 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: VYLVFTTNDF PWLTIIVVFP ISAGSLMLFL PHRGNKVNKW YTICICILEL LLTTYAFCYN FKMDDPLIQL SEDYKWIDFF DFYWRMGIDG LSIGTILLTG 101: FITTLATLAA FPVTRDSRFF HFLMLAMYSG QIGSFSSRDL LLFFIMWELE LIPVYLLLSM WGGKKRLYSA TKFILYTAGS SIFLLIGVLG ISLYGSNEPT 201: LNLELLANKS YPVTLEILFY IGFLIAFAVK SPIIPLHTWL PDTHGEAHYS TCMLLAGILL KMGAYGLVRI NMELLPHAHS MFSPWLLVVG TIQIIYAAST 301: SPGQRNLKKR IAYSSVSHMG FIIIGISSIT DPGLNGAILQ IISHGFIGAA LFFLAGTSYD RIRLVYLDEM GGMAISIPKI FTMFTILSMA SLALPGMSGF 401: IAEFIVFFGI ITSQKYFLIS KIFIIFVMAI GMILTPIYLL SMLRQMFYGY KLINIKNFSF FDSGPRELFL SISILLPIIG IGIYPDFVLS LASDKVESIL 501: SNYFYG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)