ATCG00820.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ribosomal protein S19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a 6.8-kDa protein of the small ribosomal subunit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ribosomal protein S19 (RPS19); FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: plastid small ribosomal subunit, chloroplast, chloroplast stroma, plastid ribosome; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S19/S15 (InterPro:IPR002222), Ribosomal protein S19 conserved site (InterPro:IPR020934), Ribosomal protein S19, bacterial-type (InterPro:IPR005732); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ribosomal protein S19 (TAIR:AT5G47320.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrC:-:84005..84283 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 10577.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 92 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: VTRSLKKNPF VAKHLLRKIE KLNTKAEKEI IITWSRASTI IPTMIGHTIA IHNGREHLPV YIIDLMVGHK LGEFSPTINF RGHAKNDNRS RR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)