ATCG00470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP synthase epsilon chain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
ATPase epsilon subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATP synthase epsilon chain (ATPE); FUNCTIONS IN: hydrogen ion transporting ATP synthase activity, rotational mechanism; INVOLVED IN: cellular respiration, mitochondrial ATP synthesis coupled proton transport; LOCATED IN: proton-transporting ATP synthase complex, thylakoid, chloroplast thylakoid membrane, chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, F1 complex, delta/epsilon subunit, N-terminal (InterPro:IPR020546), ATPase, F1 complex, delta/epsilon subunit, C-terminal (InterPro:IPR020547), ATPase, F1 complex, delta/epsilon subunit (InterPro:IPR001469). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrC:-:52265..52663 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14499.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 132 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTLNLCVLTP NRIVWDSEVK EIILSTNSGQ IGVLANHAPI ATAVDIGILK IRLANQWLTM ALMGGFARIG NNEITILVND AEKNSDIDPQ EAQQTLEIAE 101: ANLRKAEGKR QTIEANLALR RARTRVEALN TI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)