ATCG00440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes NADH dehydrogenase D3 subunit of the chloroplast NAD(P)H dehydrogenase complex | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NDHC; FUNCTIONS IN: NADH dehydrogenase activity; INVOLVED IN: photosynthesis; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 (InterPro:IPR000440); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 protein (TAIR:AT2G07751.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrC:-:50001..50363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 13840.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 1.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 120 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFLLYEYDIF WAFLLISSAI PVLAFLISGV LSPIRKGPEK LSSYESGIEP IGDAWLQFRI RYYMFALVFV VFDVETVFLY PWAMSFDVLG VSAFIEAFIF 101: VLILILGLVY AWRKGALEWS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)