ATCG00420.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NADH dehydrogenase subunit J | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes NADH dehydrogenase subunit J. Its transcription is increased upon sulfur depletion. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NADH dehydrogenase subunit J (NDHJ); FUNCTIONS IN: NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity; INVOLVED IN: cellular response to sulfate starvation, oxidation reduction; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit (InterPro:IPR001268), NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit, conserved site (InterPro:IPR020396). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrC:-:48677..49153 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18559.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 158 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQGTLSVWLA KRGLVHRSLG FDYQGIETLQ IKPEDWHSIA VILYVYGYNY LRSQCAYDVA PGGLLASVYH LTRIEYGVNQ AEEVCIKVFT HRSNPRIPSV 101: FWVWKSTDFQ ERESYDMLGI TYDSHPRLKR ILMPESWIGW PLRKDYIAPN FYEIQDAY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)