ATCG00380.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : chloroplast ribosomal protein S4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Chloroplast encoded ribosomal protein S4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
chloroplast ribosomal protein S4 (RPS4); FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: plastid small ribosomal subunit, chloroplast stroma, chloroplast, membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S4 (InterPro:IPR001912), Ribosomal protein S4, conserved site (InterPro:IPR018079), RNA-binding S4 (InterPro:IPR002942), Ribosomal protein S4, bacterial-type (InterPro:IPR005709). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrC:-:45223..45828 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23241.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 201 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSRYRGPRFK KIRRLGALPG LTSKRPKAGS DLRNQSRSVK KSQYRIRLEE KQKLRFHYGL TEHQLLKYVR IAGKAKGSTG QVLLQLLEMR LDNILFRLGM 101: ALTIPQARQL VNHGHILVNG RIVDIPSYRC KPRDIITVKD EQNSRTLVQN LLDSSAPEEL PNHLTLHTFQ YEGLVNQIID RKCVGLKINE LLVVEYYSRQ 201: T |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)