ATCG00150.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATPase, F0 complex, subunit A protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a subunit of ATPase complex CF0, which is a proton channel that supplies the proton motive force to drive ATP synthesis by CF1 portion of the complex. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATPI; FUNCTIONS IN: hydrogen ion channel activity; INVOLVED IN: dATP biosynthetic process from ADP; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast ATP synthase complex, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, F0 complex, subunit A (InterPro:IPR000568). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrC:-:14021..14770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 27351.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 249 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNVLSCSINT LIKEGLYEIS GVEVGQHFYW QIGGFQVHAQ VLITSWVVIA ILLGSAVLAI RNPQTIPTDG QNFFEFVLEF IRDVSKTQIG EEYGPWVPFI 101: GTLFLFIFVS NWSGALLPWK IIQLPQGELA APTNDINTTV ALALLTSVAY FYAGLSKKGL GYFSKYIQPT PILLPINILE DFTKPLSLSF RLFGNILADE 201: LVVVVLVSLV PLVVPIPVMF LGLFTSGIQA LIFATLAAAY IGESMEGHH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)