ATCG00040.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : maturase K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a maturase located in the trnK intron in the chloroplast genome. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
maturase K (MATK); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Intron maturase, type II (InterPro:IPR000442), Maturase, MatK, N-terminal (InterPro:IPR002866). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chrC:-:2056..3636 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63041.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 526 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MCHFRTQENK DFTFSSNRIS IQMDKFQGYL EFDGARQQSF LYPLFFREYI YVLAYDHGLN RLNRNRYIFL ENADYDKKYS SLITKRLILR MYEQNRLIIP 101: TKDVNQNSFL GHTSLFYYQM ISVLFAVIVE IPFSLRLGSS FQGKQLKKSY NLQSIHSIFP FLEDKLGHFN YVLDVLIPYP IHLEILVQTL RYRVKDASSL 201: HFFRFCLYEY CNWKNFYIKK KSILNPRFFL FLYNSHVCEY ESIFFFLRKR SSHLRSTSYE VLFERIVFYG KIHHFFKVFV NNFPAILGLL KDPFIHYVRY 301: HGRCILATKD TPLLMNKWKY YFVNLWQCYF SVWFQSQKVN INQLSKDNLE FLGYLSSLRL NPLVVRSQML ENSFLIDNVR IKLDSKIPIS SIIGSLAKDK 401: FCNVLGHPIS KATWTDSSDS DILNRFVRIC RNISHYYSGS SKKKNLYRIK YILRLCCVKT LARKHKSTVR TFLKRLGSGL LEEFLTGEDQ VLSLIFPRSY 501: YASKRLYRVR IWYLDILYLN DLVNHE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)