AT5G67480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : BTB and TAZ domain protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
BTB and TAZ domain protein. Located in cytoplasm and expressed in fruit, flower and leaves. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
BTB and TAZ domain protein 4 (BT4); FUNCTIONS IN: transcription regulator activity; INVOLVED IN: response to auxin stimulus, response to gibberellin stimulus; LOCATED IN: plasma membrane, cytoplasm; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: BTB/POZ (InterPro:IPR013069), Zinc finger, TAZ-type (InterPro:IPR000197), BTB/POZ fold (InterPro:IPR011333), Kelch related (InterPro:IPR013089), BTB/POZ-like (InterPro:IPR000210); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: BTB and TAZ domain protein 5 (TAIR:AT4G37610.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:26931055..26932496 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42463.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 372 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVTGCVDLHQ SFKSADSSSV PIPPPLPSKS DGLKKKLGHS SVSTATRDMW DRLFNDGYKA DVVIYTDNGS IIYAHANILG TASTVIKGML KQAKRHGKWH 101: TISIRGVPHD AVRVFIRFLY SSCYEKEEMN EFIMHLLLLS HAYVVPQLKR VCEWHLEHGL LTTENVVDVF QLALLCDFPR LSLISHRMIM KHFNELSATE 201: AWTAMKKSHP FLEKEVRDSV IIEANTRKER MRKRNDQRIY SQLYEAMEAL VHICRDGCKT IGPHDKDFKP NHATCNYEAC KGLESLIRHF AGCKLRVPGG 301: CVHCKRMWQL LELHSRVCAG SDQCRVPLCR NLKEKMEKQS KKDESRWKLL VKNVLGSKKI GGSPFFLPVT NC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)