AT5G67260.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
7-day old Arabidopsis seedling (no marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CYCLIN D3;2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encode CYCD3;2, a CYCD3 D-type cyclin. Important for determining cell number in developing lateral organs. Mediating cytokinin effects in apical growth and development. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CYCLIN D3;2 (CYCD3;2); FUNCTIONS IN: cyclin-dependent protein kinase activity; INVOLVED IN: regulation of cell cycle, regulation of cell proliferation; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclin, C-terminal (InterPro:IPR004367), Cyclin D (InterPro:IPR015451), Cyclin-like (InterPro:IPR011028), Cyclin-related (InterPro:IPR013763), Cyclin, N-terminal (InterPro:IPR006671), Cyclin (InterPro:IPR006670); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CYCLIN D3;3 (TAIR:AT3G50070.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:26836313..26837665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42353.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 367 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALEKEEEAS QNGAFCVLDG LYCEEETGFV EDDLDDDGDL DFLEKSDESV VKFQFLPLLD MFLWDDDEIL SLISKENETN PCFGEQILDG FLVSCRKEAL 101: DWVLRVKSHY GFTSLTAILA VNYFDRFMTS IKLQTDKPWM SQLVAVASLS LAAKVEEIQV PLLLDLQVEE ARYLFEAKTI QRMELLILST LQWRMHPVTP 201: ISFFDHIIRR FGSKWHQQLD FCRKCERLLI SVIADTRFMR YFPSVLATAI MILVFEELKP CDEVEYQSQI TTLLKVNQEK VNECYELLLE HNPSKKRMMN 301: LVDQDSPSGV LDFDDSSNSS WNVSTTASVS SSSSSPEPLL KRRRVQEQQM RLPSINRMFL DVLSSPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)