AT5G67030.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : zeaxanthin epoxidase (ZEP) (ABA1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a single copy zeaxanthin epoxidase gene that functions in first step of the biosynthesis of the abiotic stress hormone abscisic acid (ABA). Mutants in this gene are unable to express female sterility in response to beta-aminobutyric acid, as wild type plants do. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ABA DEFICIENT 1 (ABA1); FUNCTIONS IN: zeaxanthin epoxidase activity; INVOLVED IN: in 7 processes; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: SMAD/FHA domain (InterPro:IPR008984), Zeaxanthin epoxidase (InterPro:IPR017079), Monooxygenase, FAD-binding (InterPro:IPR002938), Forkhead-associated (FHA) domain (InterPro:IPR000253); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein (TAIR:AT2G35660.1); Has 6841 Blast hits to 6837 proteins in 1107 species: Archae - 14; Bacteria - 3761; Metazoa - 2; Fungi - 1599; Plants - 605; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 860 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:26753745..26757090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 73846.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 667 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSTPFCYSI NPSPSKLDFT RTHVFSPVSK QFYLDLSSFS GKPGGVSGFR SRRALLGVKA ATALVEKEEK REAVTEKKKK SRVLVAGGGI GGLVFALAAK 101: KKGFDVLVFE KDLSAIRGEG KYRGPIQIQS NALAALEAID IEVAEQVMEA GCITGDRING LVDGISGTWY VKFDTFTPAA SRGLPVTRVI SRMTLQQILA 201: RAVGEDVIRN ESNVVDFEDS GDKVTVVLEN GQRYEGDLLV GADGIWSKVR NNLFGRSEAT YSGYTCYTGI ADFIPADIES VGYRVFLGHK QYFVSSDVGG 301: GKMQWYAFHE EPAGGADAPN GMKKRLFEIF DGWCDNVLDL LHATEEEAIL RRDIYDRSPG FTWGKGRVTL LGDSIHAMQP NMGQGGCMAI EDSFQLALEL 401: DEAWKQSVET TTPVDVVSSL KRYEESRRLR VAIIHAMARM AAIMASTYKA YLGVGLGPLS FLTKFRVPHP GRVGGRFFVD IAMPSMLDWV LGGNSEKLQG 501: RPPSCRLTDK ADDRLREWFE DDDALERTIK GEWYLIPHGD DCCVSETLCL TKDEDQPCIV GSEPDQDFPG MRIVIPSSQV SKMHARVIYK DGAFFLMDLR 601: SEHGTYVTDN EGRRYRATPN FPARFRSSDI IEFGSDKKAA FRVKVIRKTP KSTRKNESNN DKLLQTA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)