AT5G66990.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : RWP-RK domain-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
RWP-RK domain-containing protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Plant regulator RWP-RK (InterPro:IPR003035); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RWP-RK domain-containing protein (TAIR:AT1G74480.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:26744257..26745362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32394.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 277 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADQRPLMTW LEANNYESFL QEDIFSFLDQ SLFVDPHSSF IDPFKDFQTQ NWFSLQDSIV NHISTTFAAD HTFLASLDLE AISSTFSLDI SSGWWNENNG 101: NYNNQVEPNL DEISRTNTMG DPNMEQILHE DVNTMKEKTS QKRIIMKRRY REDGVINNMS REMMKQYFYM PITKAAKELN IGVTLLKKRC RELGIPRWPH 201: RKLTSLNALI ANLKDLLGNT KGRTPKSKLR NALELLEMEK KMIEEVPDLE FGDKTKRLRQ ACFKAKYKRR RLFSSSS |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)