AT5G66680.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 ASURE: endoplasmic reticulum What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycosyltransferase 48kDa subunit family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein ortholog of human SOT48 or yeast WBP1, an essential protein subunit of the oligosaccharyltransferase (OST) complex, which is responsible for the transfer in the ER of the N-linked glycan precursor onto Asn residues of candidate proteins. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
DEFECTIVE GLYCOSYLATION (DGL1); FUNCTIONS IN: dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycotransferase activity; INVOLVED IN: plant-type cell wall organization, protein amino acid N-linked glycosylation via asparagine, unidimensional cell growth; LOCATED IN: in 8 components; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycosyltransferase 48kDa subunit (InterPro:IPR005013); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:26617840..26620581 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48746.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 437 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVNLSRSVAL ISVFLLPLLS FSFSVDNPTD RRVLVLLDDL SLKSSHSIFF NTLKSRGFDL DFKLAEDSKL ALQRYGQYLY DGLIIFAPST ERFGGSLDSK 101: SIADFVDSGR DLILSADTAA SDLIRGIATE CGVDFDEDSS AMVIDHTSFS VSDVDGDHTL IAADDLVKSD VILGKTKIEA PVLFRGVAHS LNPTNNLVLK 201: VLSASPSAYS ANPSSKLSSP PQLTGSSISL VSVMQARNNA RVVISGSVQL FSDRLIRSGV QKAGSPNQYE KSGNEQFVTE LSKWVFHERG HLKAGNLVHH 301: RVGETDEPAI YRIKDDLEFS VEIYEWSGKS WEPYVANDVQ VQFYMMSPYV LKTLSTDKKG LFHTSFKVPD VYGVFQFKVE YEKLGYTTLS LSKQIPVRPY 401: RHNEYERFIP TAYPYYGACF TTMAGFFVFS FVYLYHK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)