AT5G66620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.501 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DA1-related protein 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
DA1-related protein 6 (DAR6); FUNCTIONS IN: zinc ion binding; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Zinc finger, LIM-type (InterPro:IPR001781), Ubiquitin interacting motif (InterPro:IPR003903), Protein of unknown function DUF3633 (InterPro:IPR022087); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DA1-related protein 5 (TAIR:AT5G66630.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:26588585..26592006 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 73649.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 644 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASDYYSSDD EGFGEKVGLI GEKDRFEAET IHVIEVSQHE ADIQKAKQRS LATHEAEKLD LATHEAEQLD LAIQEFSRQE EEEERRRTRE LENDAQIANV 101: LQHEERERLI NKKTALEDEE DELLARTLEE SLKENNRRKM FEEQVNKDEQ LALIVQESLN MEEYPIRLEE YKSISRRAPL DVDEQFAKAV KESLKNKGKG 201: KQFEDEQVKK DEQLALIVQE SLNMVESPPR LEENNNISTR APVDEDEQLA KAVEESLKGK GQIKQSKDEV EGDGMLLELN PPPSLCGGCN FAVEHGGSVN 301: ILGVLWHPGC FCCRACHKPI AIHDIENHVS NSRGKFHKSC YERYCYVCKE KKMKTYNNHP FWEERYCPVH EADGTPKCCS CERLEPRESN YVMLADGRWL 401: CLECMNSAVM DSDECQPLHF DMRDFFEGLN MKIEKEFPFL LVEKQALNKA EKEEKIDYQY EVVTRGICLS EEQIVDSVSQ RPVRGPNNKL VGMATESQKV 501: TRECEVTAIL ILYGLPRLLT GYILAHEMMH AYLRLNGHRN LNNILEEGIC QVLGHLWLDS QTYATADATA DASSSASSSS RTPPAASASK KGEWSDFDKK 601: LVEFCKNQIE TDDSPVYGLG FRTVNEMVTN SSLQETLKEI LRQR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)