AT5G66170.3
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:cytosol 0.977 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : sulfurtransferase 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a thiosulfate sulfurtransferase/rhodanese. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
sulfurtransferase 18 (STR18); FUNCTIONS IN: thiosulfate sulfurtransferase activity; INVOLVED IN: aging; LOCATED IN: cytoplasm; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rhodanese-like (InterPro:IPR001763); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Rhodanese/Cell cycle control phosphatase superfamily protein (TAIR:AT2G17850.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr5:+:26447828..26448586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 14883.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 5.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 136 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSQSISSSTK AEEVVSVDVS QAKTLLQSGH QYLDVRTQDE FRRGHCEAAK IVNIPYMLNT PQGRVKNQEF LEQVSSLLNP ADDILVGCQS GARSLKATTE 101: LVAAGYKKVR NVGGGYLAWV DHSFPINTEE EEPSAN |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)