AT5G66120.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 3-dehydroquinate synthase, putative | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
3-dehydroquinate synthase, putative; FUNCTIONS IN: 3-dehydroquinate synthase activity; INVOLVED IN: aromatic amino acid family biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 3-dehydroquinate synthase AroB, subgroup (InterPro:IPR016037), 3-dehydroquinate synthase AroB (InterPro:IPR002658); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:26431516..26433649 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48066.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 442 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAANTISLSN VAASKNLNSF QSRAFIAPPT IFFPVASAKS KPGELSLSST TLSRSRVRAG ASQLMNEPLN DQRSISSPTV VEVDLGDRSY PIYIGAGLLD 101: HSELLQRHVH GKRVLVVTND RVAPLYLDKT IDALTRGNPN VTVESVILPD GEKYKDMDTL MKVFDKAIES RLDRRCTFVA LGGGVIGDMC GYAAASYLRG 201: VNFIQIPTTV MAQVDSSVGG KTGINHRLGK NLIGAFYQPQ CVLVDTDTLN TLPDREMASG LAEVIKYGLI RDAEFFEWQE KNIEALLARD PAALAFAIKR 301: SCENKADVVS QDEKESGLRA TLNLGHTFGH AIETGFGYGE WLHGEAVAAG TVMAVDMSYR LGWIDESIVK RVNKILVRAK LPTTPPESMT VSMFKSIMAV 401: DKKVADGLLR LILLKGPLGN CVFTGDYDRE ALDATLRAFS KS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)