AT5G65930.3
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.769 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : kinesin-like calmodulin-binding protein (ZWICHEL) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a novel member of the kinesin superfamily of motor proteins. recessive mutations have reduced number of trichome branches. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ZWICHEL (ZWI); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FERM central domain (InterPro:IPR019748), Prismane-like (InterPro:IPR011254), MyTH4 domain (InterPro:IPR000857), Kinesin, motor domain (InterPro:IPR001752), Band 4.1 domain (InterPro:IPR019749), FERM, N-terminal (InterPro:IPR018979), Kinesin, motor region, conserved site (InterPro:IPR019821), FERM/acyl-CoA-binding protein, 3-helical bundle (InterPro:IPR014352), FERM domain (InterPro:IPR000299); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Di-glucose binding protein with Kinesin motor domain (TAIR:AT2G22610.2). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:26370369..26376394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 144098.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1266 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MEGQRGSNSS LSSGNGTEVA TDVSSCFYVP NPSGTDFDAE SSSLPPLLSL CHSSPAPQVA LSIPAELAAA IPLIDRFQVE AFLRLMQKQI QSAGKRGFFY 0101: SKKSSGSNVR ERFTFEDMLC FQKDPIPTSL LKINSDLVSR ATKLFHLILK YMGVDSSDRS TPPSLDERID LVGKLFKKTL KRVELRDELF AQISKQTRHN 0201: PDRQYLIKAW ELMYLCASSM PPSKDIGGYL SEYIHNVAHD ATIEPDAQVL AVNTLKALKR SIKAGPRHTT PGREEIEALL TGRKLTTIVF FLDETFEEIS 0301: YDMATTVSDA VEELAGTIKL SAFSSFSLFE CRKVVSSSKS SDPGNEEYIG LDDNKYIGDL LAEFKAIKDR NKGEILHCKL VFKKKLFRES DEAVTDLMFV 0401: QLSYVQLQHD YLLGNYPVGR DDAAQLCALQ ILVGIGFVNS PESCIDWTSL LERFLPRQIA ITRAKREWEL DILARYRSME NVTKDDARQQ FLRILKALPY 0501: GNSVFFSVRK IDDPIGLLPG RIILGINKRG VHFFRPVPKE YLHSAELRDI MQFGSSNTAV FFKMRVAGVL HIFQFETKQG EEICVALQTH INDVMLRRYS 0601: KARSAANSLV NGDISCSSKP QNFEVYEKRL QDLSKAYEES QKKIEKLMDE QQEKNQQEVT LREELEAIHN GLELERRKLL EVTLDRDKLR SLCDEKGTTI 0701: QSLMSELRGM EARLAKSGNT KSSKETKSEL AEMNNQILYK IQKELEVRNK ELHVAVDNSK RLLSENKILE QNLNIEKKKK EEVEIHQKRY EQEKKVLKLR 0801: VSELENKLEV LAQDLDSAES TIESKNSDML LLQNNLKELE ELREMKEDID RKNEQTAAIL KMQGAQLAEL EILYKEEQVL RKRYYNTIED MKGKIRVYCR 0901: IRPLNEKESS EREKQMLTTV DEFTVEHPWK DDKRKQHIYD RVFDMRASQD DIFEDTKYLV QSAVDGYNVC IFAYGQTGSG KTFTIYGHES NPGLTPRATK 1001: ELFNILKRDS KRFSFSLKAY MVELYQDTLV DLLLPKSARR LKLEIKKDSK GMVFVENVTT IPISTLEELR MILERGSERR HVSGTNMNEE SSRSHLILSV 1101: VIESIDLQTQ SAARGKLSFV DLAGSERVKK SGSAGCQLKE AQSINKSLSA LGDVIGALSS GNQHIPYRNH KLTMLMSDSL GGNAKTLMFV NVSPAESNLD 1201: ETYNSLLYAS RVRTIVNDPS KHISSKEMVR LKKLVAYWKE QAGKKGEEED LVDIEEDRTR KDEADS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)