AT5G65930.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.933 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : kinesin-like calmodulin-binding protein (ZWICHEL) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a novel member of the kinesin superfamily of motor proteins. recessive mutations have reduced number of trichome branches. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ZWICHEL (ZWI); FUNCTIONS IN: microtubule motor activity, calmodulin binding; INVOLVED IN: trichome branching, pollen germination; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FERM central domain (InterPro:IPR019748), Prismane-like (InterPro:IPR011254), MyTH4 domain (InterPro:IPR000857), Kinesin, motor domain (InterPro:IPR001752), FERM, N-terminal (InterPro:IPR018979), Band 4.1 domain (InterPro:IPR019749), Kinesin, motor region, conserved site (InterPro:IPR019821), FERM/acyl-CoA-binding protein, 3-helical bundle (InterPro:IPR014352), FERM domain (InterPro:IPR000299); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Di-glucose binding protein with Kinesin motor domain (TAIR:AT2G22610.1); Has 92267 Blast hits to 53660 proteins in 2386 species: Archae - 1115; Bacteria - 10663; Metazoa - 44616; Fungi - 7060; Plants - 5081; Viruses - 192; Other Eukaryotes - 23540 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:26370369..26376394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 143457.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1260 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MEGQRGSNSS LSSGNGTEVA TDVSSCFYVP NPSGTDFDAE SSSLPPLSPA PQVALSIPAE LAAAIPLIDR FQVEAFLRLM QKQIQSAGKR GFFYSKKSSG 0101: SNVRERFTFE DMLCFQKDPI PTSLLKINSD LVSRATKLFH LILKYMGVDS SDRSTPPSLD ERIDLVGKLF KKTLKRVELR DELFAQISKQ TRHNPDRQYL 0201: IKAWELMYLC ASSMPPSKDI GGYLSEYIHN VAHDATIEPD AQVLAVNTLK ALKRSIKAGP RHTTPGREEI EALLTGRKLT TIVFFLDETF EEISYDMATT 0301: VSDAVEELAG TIKLSAFSSF SLFECRKVVS SSKSSDPGNE EYIGLDDNKY IGDLLAEFKA IKDRNKGEIL HCKLVFKKKL FRESDEAVTD LMFVQLSYVQ 0401: LQHDYLLGNY PVGRDDAAQL CALQILVGIG FVNSPESCID WTSLLERFLP RQIAITRAKR EWELDILARY RSMENVTKDD ARQQFLRILK ALPYGNSVFF 0501: SVRKIDDPIG LLPGRIILGI NKRGVHFFRP VPKEYLHSAE LRDIMQFGSS NTAVFFKMRV AGVLHIFQFE TKQGEEICVA LQTHINDVML RRYSKARSAA 0601: NSLVNGDISC SSKPQNFEVY EKRLQDLSKA YEESQKKIEK LMDEQQEKNQ QEVTLREELE AIHNGLELER RKLLEVTLDR DKLRSLCDEK GTTIQSLMSE 0701: LRGMEARLAK SGNTKSSKET KSELAEMNNQ ILYKIQKELE VRNKELHVAV DNSKRLLSEN KILEQNLNIE KKKKEEVEIH QKRYEQEKKV LKLRVSELEN 0801: KLEVLAQDLD SAESTIESKN SDMLLLQNNL KELEELREMK EDIDRKNEQT AAILKMQGAQ LAELEILYKE EQVLRKRYYN TIEDMKGKIR VYCRIRPLNE 0901: KESSEREKQM LTTVDEFTVE HPWKDDKRKQ HIYDRVFDMR ASQDDIFEDT KYLVQSAVDG YNVCIFAYGQ TGSGKTFTIY GHESNPGLTP RATKELFNIL 1001: KRDSKRFSFS LKAYMVELYQ DTLVDLLLPK SARRLKLEIK KDSKGMVFVE NVTTIPISTL EELRMILERG SERRHVSGTN MNEESSRSHL ILSVVIESID 1101: LQTQSAARGK LSFVDLAGSE RVKKSGSAGC QLKEAQSINK SLSALGDVIG ALSSGNQHIP YRNHKLTMLM SDSLGGNAKT LMFVNVSPAE SNLDETYNSL 1201: LYASRVRTIV NDPSKHISSK EMVRLKKLVA YWKEQAGKKG EEEDLVDIEE DRTRKDEADS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)