AT5G64210.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alternative oxidase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes an isoform of alternative oxidase, which is expressed in rosettes, stems, and roots. Transcript accumulates in dry seeds and decreased upon germination and is not affected by actinomycin A. Protein is localized to mitochondria. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
alternative oxidase 2 (AOX2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Alternative oxidase (InterPro:IPR002680); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alternative oxidase 1A (TAIR:AT3G22370.1); Has 1305 Blast hits to 1305 proteins in 244 species: Archae - 0; Bacteria - 111; Metazoa - 12; Fungi - 191; Plants - 373; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 618 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:25683965..25685664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40088.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 353 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSQLITKAAL RVLLVCGRGN CNMFVSSVSS TSVMKSPYEI TAPMRIHDWC GGFGDFKIGS KHVQGNFNLR WMGMSSASAM EKKDENLTVK KGQNGGGSVA 101: VPSYWGIETA KMKITRKDGS DWPWNCFMPW ETYQANLSID LKKHHVPKNI ADKVAYRIVK LLRIPTDIFF QRRYGCRAMM LETVAAVPGM VGGMLLHLKS 201: IRKFEHSGGW IKALLEEAEN ERMHLMTMME LVKPKWYERL LVMLVQGIFF NSFFVCYVIS PRLAHRVVGY LEEEAIHSYT EFLKDIDNGK IENVAAPAIA 301: IDYWRLPKDA TLKDVVTVIR ADEAHHRDVN HFASDIRNQG KELREAAAPI GYH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)