AT5G63990.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.992 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Inositol monophosphatase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Inositol monophosphatase family protein; FUNCTIONS IN: 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase activity, inositol or phosphatidylinositol phosphatase activity; INVOLVED IN: sulfur metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 17 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Inositol monophosphatase (InterPro:IPR000760), 3(2),5 -bisphosphate nucleotidase HAL2 (InterPro:IPR006239); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Inositol monophosphatase family protein (TAIR:AT5G64000.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:25613387..25615736 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38386.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 357 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSYDEMLSAA KKAVSLAARL SNEVRKSLLV TDVWNKSDDS PVTVADYGSQ AVVSLVLERE LQNEPVSLVA EEDSGELRKI AAETVLARIT ELVKDTLASD 101: ESYAIASPLT SDDVLNAIDR GKSEGGPKGR HWILDPIGGT RGFIRGEQYA IGLALLVEGK VVLGVMACPK LPLASTAGNA LKSLPEKVGC LFYGSVGNGT 201: YVQSLSVDSL PAKVEVSSID DPAKASFFES YHTPVPIHNT IATKLGIKES PIKINSQTKY AALSRGDGEV YLRFTRKARP ESIWNHAAGS IIVSEAGGKV 301: TDAAGNPLDF SKGKYLDYKR GIVVTTQKLL PRLLTAVRES IKEEEEEEEK AASLKLH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)