AT5G63070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein S19 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein S19 family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome, RNA binding; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: cytosolic small ribosomal subunit, ribosome; EXPRESSED IN: leaf whorl, flower; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S15, eukaryotic/archaeal (InterPro:IPR005713), Ribosomal protein S19/S15 (InterPro:IPR002222), Ribosomal protein S19 conserved site (InterPro:IPR020934); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein S19 family protein (TAIR:AT5G09500.1); Has 9984 Blast hits to 9984 proteins in 3781 species: Archae - 256; Bacteria - 5293; Metazoa - 278; Fungi - 251; Plants - 1765; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2141 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:25299178..25299660 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18577.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 160 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAINEPEFAT AVAVATKKRT FKKFSFRGFN VDALLKMSNV DLAKLFNARV RRRFYRGLKK QPLILIKKLR RAKKEASDEN KMKPEVVKTH LRNMIIVPEM 101: IGSVVGVHNG KKFNEIVIKP EMIGHYLAEF SMTCKKVNHH RPRICGCCCF RRSTRFIPLR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)