AT5G62250.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : microtubule-associated protein 65-9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
microtubule-associated protein 65-9 (MAP65-9); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Microtubule-associated protein, MAP65/ASE1-type (InterPro:IPR007145); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Microtubule associated protein (MAP65/ASE1) family protein (TAIR:AT5G51600.1); Has 14792 Blast hits to 10558 proteins in 786 species: Archae - 349; Bacteria - 1217; Metazoa - 7703; Fungi - 921; Plants - 837; Viruses - 44; Other Eukaryotes - 3721 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:25005756..25008096 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63872.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 549 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSKSQIESTW SSLLQELEII WKEVGETETE REKILIEIEE ECREVYNRKI EKVKEEKIRI KQEIADSEAR VIDICSVMEE PPILGRHHQS DQQSGNGRSL 101: KDELVKILQK LEEMEKRKSE RKIQFIQVID DIRCVREEIN GESDDETCSS DFSADESDLS LRKLEELHRE LYTLQEQKRN RVKQIQDNIR TLESLCSVLG 201: LNFRETVTKI HPSLVDTEGS RSISNETLDK LASSVQQWHE TKIQRMQELQ DLVTTMLEFW NLMDTPAEEQ QKFMDVSCNI AATVSEITKP NSLSIDLLEE 301: VKAELCRLEE LKWSKMKELV LKKRSELEEI CRRTHIVLEE EDIAVENVIK AIESGDVNPE NILEQIEYRA GKVKEEALSR KEILEKADKW LNACEEENWL 401: EEYNQDENRY NAGKGSHLIL KRAEKARALV NKLPAMVEAL ASKITIWESE KEYEFLFDGN RLLSMLEEYT ELREEKEQER RRKRDLKKHQ GQVTSEQDKG 501: SVTKPQSAKK GLKVSTNKRF VSSPHTPQTD SPHSAKSNQS FSTPLSRHG |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)