AT5G62120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : response regulator 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Response Regulator: B- Type | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
response regulator 23 (RR23); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: CheY-like (InterPro:IPR011006), Signal transduction response regulator, receiver domain (InterPro:IPR001789); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: response regulator 21 (TAIR:AT5G07210.1); Has 142 Blast hits to 142 proteins in 56 species: Archae - 8; Bacteria - 83; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 49; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:24946955..24948225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 16807.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 145 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTAKDSSEPV TTLTQFNNID VVITDYHMPG LNGVQLKKRI DEEFGNLPVI DLYRNIEHEE LFRRALCFMH KPISRRDLNS LNVVCQQALR HRMNGETNLN 101: GSGQNVTDDP DDWLRLREKP KLKWTKPLQH RFMSALKSLG VASKY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)