AT5G61810.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Mitochondrial substrate carrier family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Mitochondrial substrate carrier family protein; FUNCTIONS IN: binding, calcium ion binding; INVOLVED IN: transport, transmembrane transport; LOCATED IN: mitochondrial inner membrane, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial carrier protein (InterPro:IPR002067), EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), Mitochondrial substrate carrier (InterPro:IPR001993), Mitochondrial substrate/solute carrier (InterPro:IPR018108); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Mitochondrial substrate carrier family protein (TAIR:AT5G07320.1); Has 27340 Blast hits to 13937 proteins in 456 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 11225; Fungi - 8377; Plants - 4746; Viruses - 5; Other Eukaryotes - 2985 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:24831843..24833002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36613.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 335 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEHVDKDNNG IITFEEWRDF LLLNPHEATI ENIYHHWERV CLIDIGEQAV IPDGISAHAQ RSKLLLAGGI AGAVSRTATA PLDRLKVALQ VQRTNLGVVP 101: TIKKIWREDK LLGFFRGNGL NVAKVAPESA IKFAAYEMLK PIIGGADGDI GTSGRLLAGG LAGAVAQTAI YPMDLVKTRL QTFVSEVGTP KLWKLTKDIW 201: IQEGPRAFYR GLCPSLIGII PYAGIDLAAY ETLKDLSRAH FLHDTAEPGP LIQLGCGMTS GALGASCVYP LQVIRTRMQA DSSKTSMGQE FLKTLRGEGL 301: KGFYRGIFPN FFKVIPSASI SYLVYEAMKK NLALD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)