AT5G60360.3
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : aleurain-like protease | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a senescence-associated thiol protease. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
aleurain-like protease (ALP); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase C1A, papain (InterPro:IPR013128), Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide (InterPro:IPR013201), Peptidase C1A, papain C-terminal (InterPro:IPR000668), Peptidase, cysteine peptidase active site (InterPro:IPR000169); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cysteine proteinases superfamily protein (TAIR:AT3G45310.1); Has 8252 Blast hits to 8181 proteins in 792 species: Archae - 69; Bacteria - 357; Metazoa - 3329; Fungi - 10; Plants - 1862; Viruses - 142; Other Eukaryotes - 2483 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:24280044..24282157 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39586.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 361 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSAKTILSSV VLVVLVAASA AANIGFDESN PIRMVSDGLR EVEESVSQIL GQSRHVLSFA RFTHRYGKKY QNVEEMKLRF SIFKENLDLI RSTNKKGLSY 101: KLGVNQFADL TWQEFQRTKL GAAQNCSATL KGSHKVTEAA LPETKDWRED GIVSPVKDQG GCGSCWTFST TGALEAAYHQ AFGKGISLSE QQLVDCAGAF 201: NNYGCNGGLP SQAFEYIKSN GGLDTEKAYP YTGKDETCKF SAENVGVQVL NSVNITLGAE DELKHAVGLV RPVSIAFEVI HSFRLYKSGV YTDSHCGSTP 301: MDVNHAVLAV GYGVEDGVPY WLIKNSWGAD WGDKGYFKME MGKNMCGKYC YMCIIPRCGL R |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)