AT5G59810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.995 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Subtilase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
SBT5.4; FUNCTIONS IN: identical protein binding, serine-type endopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis, negative regulation of catalytic activity; EXPRESSED IN: 12 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, C globular stage, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protease-associated PA (InterPro:IPR003137), Proteinase inhibitor, propeptide (InterPro:IPR009020), Peptidase S8/S53, subtilisin/kexin/sedolisin (InterPro:IPR000209), Peptidase S8, subtilisin-related (InterPro:IPR015500), Peptidase S8/S53, subtilisin, active site (InterPro:IPR022398), Proteinase inhibitor I9, subtilisin propeptide (InterPro:IPR010259); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Subtilisin-like serine endopeptidase family protein (TAIR:AT2G04160.1); Has 6522 Blast hits to 5856 proteins in 960 species: Archae - 194; Bacteria - 3635; Metazoa - 89; Fungi - 206; Plants - 1959; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 439 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:24096895..24100387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 83460.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 778 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSMTRRYSST QYSNKMSLQS LSSLLLLVTL FFSPAFALKK SYIVYLGSHA HLPQISSAHL DGVAHSHRTF LASFVGSHEN AKEAIFYSYK RHINGFAAIL 101: DENEAAEIAK HPDVVSVFPN KGRKLHTTHS WNFMLLAKNG VVHKSSLWNK AGYGEDTIIA NLDTGVWPES KSFSDEGYGA VPARWKGRCH KDVPCNRKLI 201: GARYFNKGYL AYTGLPSNAS YETCRDHDGH GSHTLSTAAG NFVPGANVFG IGNGTASGGS PKARVAAYKV CWPPVDGAEC FDADILAAIE AAIEDGVDVL 301: SASVGGDAGD YMSDGIAIGS FHAVKNGVTV VCSAGNSGPK SGTVSNVAPW VITVGASSMD REFQAFVELK NGQSFKGTSL SKPLPEEKMY SLISAADANV 401: ANGNVTDALL CKKGSLDPKK VKGKILVCLR GDNARVDKGM QAAAAGAAGM VLCNDKASGN EIISDAHVLP ASQIDYKDGE TLFSYLSSTK DPKGYIKAPT 501: ATLNTKPAPF MASFSSRGPN TITPGILKPD ITAPGVNIIA AFTEATGPTD LDSDNRRTPF NTESGTSMSC PHISGVVGLL KTLHPHWSPA AIRSAIMTTS 601: RTRNNRRKPM VDESFKKANP FSYGSGHVQP NKAAHPGLVY DLTTGDYLDF LCAVGYNNTV VQLFAEDPQY TCRQGANLLD FNYPSITVPN LTGSITVTRK 701: LKNVGPPATY NARFREPLGV RVSVEPKQLT FNKTGEVKIF QMTLRPLPVT PSGYVFGELT WTDSHHYVRS PIVVQLSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)