AT5G57280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; FUNCTIONS IN: methyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Uncharacterised protein family, methyltransferase, Williams-Beuren syndrome (InterPro:IPR022238), Methyltransferase type 11 (InterPro:IPR013216); Has 984 Blast hits to 969 proteins in 433 species: Archae - 16; Bacteria - 445; Metazoa - 145; Fungi - 145; Plants - 54; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 179 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:23204533..23206485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32388.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 289 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSNRPELLAP PEIFYDDTEA RKYTSSSRIV EIQAKLSERA LELLALPEDG VPRFLLDIGC GSGLSGETLS EDGHHWIGLD ISASMLHVAV EREVEGDLLL 101: GDMGQGLGLR SGVIDGAISI SAVQWLCNAD KSSHEPRLRL KAFFGSLYRC LSRGARAVFQ VYPENIAQRE LILRQALQAG FGGGLVVDYP HSTKKRKEFL 201: VLTCGTVQTS IQTSKNEYDE SCSEDDNSDD EESEEVGVSD RNRPRKRQRT NTKVKGREWV LRKKEQSRRK GKNVPADSKF TSRKRRTRF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)