AT5G57260.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.700 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
putative cytochrome P450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 10 (CYP71B10); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 34 (TAIR:AT3G26300.1); Has 32483 Blast hits to 32205 proteins in 1643 species: Archae - 48; Bacteria - 3002; Metazoa - 11999; Fungi - 6846; Plants - 9547; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1038 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:23198694..23200273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57508.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 502 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTVLWFVSLI LLISILLVAV KHSKRRWVRQ PPSPPGLPII GNLHQLGELP HQSLCKLSKK YGPVMLLKLG RVPTVIVSTP ETAKQVLKDY DLHCCSRPSL 101: EGTRKLSYNY LDIAFSRFDD YWKELRKLCV EELFCNKRIN SIQPIKEAEM EKLIDSIAES ASQKTLVNLS DTFLSLNVNV ICKAVFGVNF QGTVLNNDKF 201: QDLVHEALEM LGSFSASDFF PYVGWIVDWF TGLHARRERS VRDLDAFYEQ MIDLHLQKNR EESEDDFVDL LLRLEKEEAV LGYGKLTRNH IKAILMNILL 301: GGINTSAITM TWAMAELIRN PRVMKKVQSE IRAQIGKNNK TRIISLDEIN HLSYLNMVIK ETCRLHPVAP LLVPREVISE FKINGYTIQP KTRLHVNVWA 401: IGRDPEIWKD PEEFLPERFM DCDIDVKGQD YELLPFGSGR RICPAVYMGI TTVEFGLANL LYHFDWKLPE GVAVEDIYMD EASGLTSHKK HDLLLVPVKS 501: LV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)