AT5G56740.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : histone acetyltransferase of the GNAT family 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an enzyme with histone acetyltransferase activity. Histone H4 is the primary substrate for the enzyme. Prior acetylation of lysine 12 of histone H4 reduces radioactive acetylation by HAG2. HAG2 acetylates histone H4 lysine 12. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
histone acetyltransferase of the GNAT family 2 (HAG2); FUNCTIONS IN: histone acetyltransferase activity, H4 histone acetyltransferase activity; INVOLVED IN: histone acetylation, chromatin modification, chromatin silencing at telomere; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Histone acetyltransferase type B, catalytic subunit (InterPro:IPR017380), GCN5-related N-acetyltransferase, C-terminal (InterPro:IPR022610), Acyl-CoA N-acyltransferase (InterPro:IPR016181), Histone acetyl transferase HAT1 N-terminal (InterPro:IPR019467); Has 368 Blast hits to 368 proteins in 193 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 119; Fungi - 147; Plants - 50; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 52 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:22953009..22955577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52741.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 467 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVQKQQASAG PGTEPKKRRR VGFSPADTGV EANECIKIYL VSSKEEVDSS DISSVKPVDL NDFFDGDGKI YGYQGLKINV WINSISLHSY ADITYQSTIN 101: GDKGITDLKS ALQNIFAETI VDTKDEFLQT FSTQRDFIRN MVSNGEVMHA GATDGSSKNA EVVPSDPQVI RMEIGSPNAG LLYSRLVPLV LLFVDGSNPI 201: DVTDPDWHLY LLIQKKEEKE DPLYRIVGFT AIYKFYRYPD RLRMRLSQIL VLPSFQGKGL GSYLMEVVNN VAITENVYDL TVEEPSEKFQ HIRTCIDINR 301: LRSFDPIKPD IDSAVQTLTK GKLSKKAQIP RFTPPLNAIE KVRESLKINK KQFLKCWEIL IYLALDPIDK YMEDYTSVIT NHVRTDILGK DIETPKKQVV 401: DVPSSFEPEA SFVVFKSVNG EEANTNVQVD ENKPDQEQQL KQLVEERIRE IKLVAEKVSK SGQTLKV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)