AT5G56650.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.785 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : IAA-leucine resistant (ILR)-like 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a protein similar to IAA conjugate hydrolases. Enzyme assays with purified GST-tagged protein shows some activity in vitro but too low to be physiologically significant. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
IAA-leucine resistant (ILR)-like 1 (ILL1); FUNCTIONS IN: metallopeptidase activity, IAA-amino acid conjugate hydrolase activity; INVOLVED IN: proteolysis, auxin metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M20 (InterPro:IPR002933), Peptidase M20D, mername-AA028/carboxypeptidase Ss1 (InterPro:IPR017439), Peptidase M20, dimerisation (InterPro:IPR011650), Peptidase M20D, amidohydrolase (InterPro:IPR010168); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: IAA-leucine resistant (ILR)-like 2 (TAIR:AT5G56660.1); Has 13181 Blast hits to 13171 proteins in 2001 species: Archae - 137; Bacteria - 9700; Metazoa - 62; Fungi - 245; Plants - 308; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2729 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:22930825..22932488 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47694.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 438 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALNNFLTFQ LLLLLLRVSS ESPWIVAGDV SRIPINFLEL AKSPEVFDSM VRIRRKIHEN PELGYEEFET SKFIRSELDL IGVKYRFPVA ITGIIGYIGT 101: GEPPFVALRA DMDALPIQEA VEWEHKSKNP GKMHACGHDG HVAMLLGAAK ILQQHRQHLQ GTVVLIFQPA EEGLSGAKMM REEGALKNVE AIFGIHLSPR 201: TPFGKAASLA GSFMAGAGAF EAVITGKGGH AAIPQHTIDP VVAASSIVLS LQHLVSRETD PSDSKVVTVT KVNGGNAFNV IPDSITIGGT LRAFTGFTQL 301: QERIKEIITK QAAVHRCNAS VNLAPNGNQP MPPTVNNMDL YKKFKKVVRD LLGQEAFVEA VPEMGSEDFS YFAETIPGHF SLLGMQDETQ GYASSHSPHY 401: RINEDVLPYG AAIHATMAVQ YLKDKASKGS VSGFHDEL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)