AT5G56330.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha carbonic anhydrase 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
alpha carbonic anhydrase 8 (ACA8); FUNCTIONS IN: carbonate dehydratase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: one-carbon metabolic process, cyanate metabolic process; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbonic anhydrase, alpha-class, catalytic domain (InterPro:IPR001148), Carbonic anhydrase, CAH1-like (InterPro:IPR018340); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha carbonic anhydrase 5 (TAIR:AT1G08065.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:22813768..22816162 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38169.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 350 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKISSLGWVL VLIFISITIV SSAPAPKPPK PKPAPAPTPP KPKPTPAPTP PKPKPKPAPT PPKPKPAPAP TPPKPKPAPA PTPPKPKPKP APTPPNPKPT 101: PAPTPPKPKP APAPAPTPAP KPKPAPKPAP GGEVEDETEF SYETKGNKGP AKWGTLDAEW KMCGIGKMQS PIDLRDKNVV VSNKFGLLRS QYLPSNTTIK 201: NRGHDIMLKF KGGNKGIGVT IRGTRYQLQQ LHWHSPSEHT INGKRFALEE HLVHESKDKR YAVVAFLYNL GASDPFLFSL EKQLKKITDT HASEEHIRTV 301: SSKQVKLLRV AVHDASDSNA RPLQAVNKRK VYLYKPKVKL MKKYCNISSY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)