AT5G54590.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.571 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 12 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT5G15730.2); Has 39067 Blast hits to 38752 proteins in 1020 species: Archae - 20; Bacteria - 845; Metazoa - 11608; Fungi - 1169; Plants - 22440; Viruses - 100; Other Eukaryotes - 2885 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:22180480..22181900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28890.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 261 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEGESKGLIV GISLGLVIGV VLAISALFCF RYHRKKSQIV NSGSRRSATI PIRENGADSC NIMSDSTIGP DSPVKSSKNG RSVWLEGFSK RSNVISASGI 101: LEYSYRDLQK ATCNFTTLIG QGAFGPVYKA QMSTGEIVAV KVLATDSKQG EKEFQTEVML LGRLHHRNLV NLIGYCAEKG QHMLIYVYMS KGSLASHLYS 201: EKHEPLSWDL RVYIALDVAR GLEYLHDGVS CLLKPFTILM HLLNNNFKTH VLINCSRLFL L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)