AT5G51270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.509 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : U-box domain-containing protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
U-box domain-containing protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: ubiquitin-protein ligase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, protein ubiquitination; LOCATED IN: ubiquitin ligase complex; EXPRESSED IN: embryo, flower; EXPRESSED DURING: C globular stage, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), U box domain (InterPro:IPR003613), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: U-box domain-containing protein kinase family protein (TAIR:AT4G25160.1); Has 113123 Blast hits to 111744 proteins in 4442 species: Archae - 111; Bacteria - 13379; Metazoa - 41065; Fungi - 8823; Plants - 33441; Viruses - 263; Other Eukaryotes - 16041 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:20835137..20838262 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 91825.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 819 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDSFFKNSYL DPKAVRAQLP KRADLAAPSE PMTVALAISG SIKSKNVIKW ALNKFGSDKN VTFKLIHIHP KITTLPTASG NIVSISEELE EVAAAYRQKV 101: MQETKETLLK PFKKMCERKK LKIDETRFES SLTKVAVELQ VLESNSVAVA ITKEVNQHLI SNLIIGRSSQ AASSRNYDIT ASISASVSNL CTVYVVSNGG 201: VHILAKDTSD TERNDTSIES GFERTSSSCS SGSGANSDVM SNALKSNPHT LSNKRMQNLP TIVRGVSVPM ETSSTESDET KKRSSDAAEE ASKRSSPETS 301: RSVSWNPQFR DFDERKDAMS SMSSNFEYGN VVTPLGHYFT DNQDTLNEIS KLRAELRHAH EMYAVAQVET LDASRKLNEL KFEELTLLEH ETKGIAKKET 401: EKFEQKRREE REAAQRREAE MKATHEAKEK EKLEESSLVA PKLQYQEFTW EEIINATSSF SEDLKIGMGA YGDVYKCNLH HTIAAVKVLH SAESSLSKQF 501: DQELEILSKI RHPHLVLLLG ACPDHGALVY EYMENGSLED RLFQVNDSQP IPWFVRLRIA WEVASALVFL HKSKPTPIIH RDLKPANILL NHNFVSKVGD 601: VGLSTMIQAA DPLSTKFTMY KQTSPVGTLC YIDPEYQRTG RISPKSDVYA FGMIILQLLT GQQAMALTYT VETAMENNND DELIQILDEK AGNWPIEETR 701: QLAALALQCT ELRSKDRPDL EDQILPVLES LKKVADKARN SLSAAPSQPP SHFFCPLLKD VMKEPCIAAD GYTYDRRAIE EWMENHRTSP VTNSPLQNVN 801: LLPNHTLYAA IVEWRNRNQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)