AT5G50240.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : protein-l-isoaspartate methyltransferase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
L-isoaspartyl methyltransferase 2 (PIMT2)gene, alternatively spliced. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
protein-l-isoaspartate methyltransferase 2 (PIMT2); FUNCTIONS IN: protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase activity; INVOLVED IN: protein modification process; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase (InterPro:IPR000682); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: protein-l-isoaspartate methyltransferase 1 (TAIR:AT3G48330.2); Has 5558 Blast hits to 5557 proteins in 1434 species: Archae - 348; Bacteria - 3661; Metazoa - 345; Fungi - 95; Plants - 108; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1001 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:20451251..20452461 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33988.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 309 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNTNTQTEQQ IIREETRIDK IIKKRKKKMR AQVLLCPTIT AYGRLYCAPR RLHRYNSSSS SSQFLNLNLS RFSGALFFHM EQFQSGTGSS GKRGMVENLK 101: RYGVISSKRV AQVMEALDRG LFVPVGSSAY VDTPVPIGYN ATISAPHMHA TCLQLLEDKL HPGMRALDVG SGTGYLTGCF ALMVGAEGRV VGVDHIPELV 201: DMSIKNIEKS VAASFLKKGS LSLHVGDGRK GWQEFAPYDA IHVGAAASEI PQPLLDQLKP GGRMVIPLGT YFQELKVIDK NEDGSIKVHT ETSVRYVPLT 301: SRVEQLGGF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)