AT5G45770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.851 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : receptor like protein 55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
receptor like protein 55 (RLP55); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: receptor like protein 51 (TAIR:AT4G18760.1); Has 93706 Blast hits to 31251 proteins in 1137 species: Archae - 18; Bacteria - 5828; Metazoa - 23619; Fungi - 1040; Plants - 57482; Viruses - 11; Other Eukaryotes - 5708 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:18563568..18564845 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47176.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 425 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKPQQPQPPL LLLLLLPLLL TTVSSYPLNP KQLKALQSLN ISTPTNDPCN NNNNQSSSSS ITCDDASPYR HITSISFTNC SSTLSLPSKT LKPLSKSLIS 101: LSFTNCPSLS PPYHLPISLH SFSAVSSFLQ NNRTKLSGLF LARLKNLKTL YISSTPIQTS RRLYVILGNM HKLTSLTISN SNLTGLIPKS FHSNLRYIDL 201: SNNSLKGSIR ISITRLKNLK SLNLSHNSLS GQIPNKIKSL TFLKNLSLAS NKLSGTIPNS LSSISELTHL DLSMNQLNGT VPSFFSEMKN LKHLNLADNS 301: FHGVLPFNES FIKNLNFFEI GRNSELCYNK TVLSSNLKLE GLAPCDKYGF PLWSPSQKEE SLSGENDYDV EGGNEEKTEN LKTKEEEEEE HKGSNKTLFG 401: LGIGLFSLVF LILFLFYLAK RCRLI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)