AT5G44990.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:cytosol 0.991 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : Glutathione S-transferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
Glutathione S-transferase family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutathione S-transferase, predicted (InterPro:IPR016639), Glutathione S-transferase, C-terminal-like (InterPro:IPR010987), Glutathione S-transferase/chloride channel, C-terminal (InterPro:IPR017933), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glutathione S-transferase family protein (TAIR:AT4G19880.1); Has 2474 Blast hits to 2474 proteins in 819 species: Archae - 30; Bacteria - 1545; Metazoa - 25; Fungi - 237; Plants - 128; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 509 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr5:+:18163370..18164768 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 40614.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 5.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 350 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATPMENENP NFARTATSFR NFVSKDPDSQ FPAESGRYHL YISYACPWAS RCLAILKLKG LDKAISFSSV QPLWRNTKEN DEHMGWVFPD SDTEVLGAER 101: DHINGAKSVR ELYDIASSNY TGKYTVPVLW DKKLKTIVNN ESSEILRMFN TEFNHVAENP SLDLYPPNLR AIIDETNEWI HDGINNGVYK CGFATNQETY 201: DVEVKRLYEA LDRCEDILRK QRFLCGNTLT ESDIRLFVTV IRFDEAYAVI FKCDKRLVRE YYHLFNYTKD IYQIAGMSST VKMDHIKQNY YGSFPSINPL 301: EIIAHGPNID YSLPHDRHRF SLESDYTRLE LFESASFVCE LKLIEIFDSL |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)