AT5G44240.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.625 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : aminophospholipid ATPase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
aminophospholipid ATPase 2 (ALA2); FUNCTIONS IN: ATPase activity, coupled to transmembrane movement of ions, phosphorylative mechanism; INVOLVED IN: metabolic process, phospholipid transport, ATP biosynthetic process; LOCATED IN: integral to membrane, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haloacid dehalogenase-like hydrolase (InterPro:IPR005834), ATPase, P-type, phospholipid-translocating, flippase (InterPro:IPR006539), ATPase, P-type, ATPase-associated domain (InterPro:IPR008250), ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter (InterPro:IPR001757), ATPase, P-type phosphorylation site (InterPro:IPR018303); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: aminophospholipid ATPase 1 (TAIR:AT5G04930.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:17817619..17823598 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 124843.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1107 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MKRFVYINDD EASKELCCDN RISNRKYTLW NFLPKNLWEQ FSRFMNQYFL LIACLQLWSL ITPVNPASTW GPLIFIFAVS ASKEAWDDYH RYLSDKKANE 0101: KEVWIVKQGI KKHIQAQDIQ VGNIVWLREN DEVPCDLVLL GTSDPQGVCY VETAALDGET DLKTRVIPSA CVGIDLELLH KMKGVIECPV PDKDIRRFDA 0201: NMRLFPPFID NDVCSLTIKN TLLQSCYLRN TEWACGVSVY TGNQTKLGMS RGIAEPKLTA MDAMIDKLTG AIFVFQIVVV LVLGIAGNVW KDTEARKQWY 0301: VQYPEEAPWY ELLVIPLRFE LLCSIMIPIS IKVSLDLVKG LYAKFIEWDV EMIDQETGTA SYAANTAISE DLGQVEYILT DKTGTLTDNK MIFRRCCIGG 0401: IFYGNENGDA LKDAQLLNAI TSGSTDVIRF LTVMAICNTV LPVQSKAGDI VYKAQSQDED ALVIAASKLH MVFVGKNANL LEIRFNGSVI RYEVLEILEF 0501: TSDRKRMSVV VKDCQNGKII LLSKGADEAI LPYARAGQQT RTIGDAVEHY SQLGLRTLCL AWRELEENEY LEWSVKFKEA SSLLVDREWR IAEVCQRLEH 0601: DLYILGVTAI EDRLQDGVPE TIETLRKAGI NFWMLTGDKQ NTAIQIALSC NFISPEPKGQ LLMIDGKTEE DVSRSLERVL LTMRITASEP KDVAFVIDGW 0701: ALEIALKHHR KDFVELAILS RTAICCRVTP SQKAQLVEIL KSCDYRTLAI GDGGNDVRMI QQADIGVGIS GREGLQAARA ADYSIGRFRF LKRLILVHGR 0801: YSYNRTAFLS QYSFYKSLLI CFIQIFFSFI SGVSGTSLFN SVSLMAYNVF YTSVPVLVSV IDKDLSEASV MQHPQILFYC QAGRLLNPST FAGWFGRSLF 0901: HAIIVFVITI HAYAYEKSEM EELGMVALSG CIWLQAFVVA QETNSFTVLQ HLSIWGNLVG FYAINFLFSA IPSSGMYTIM FRLCSQPSYW ITMFLIVGAG 1001: MGPIFALKYF RYTYRPSKIN ILQQAERMGG PILTLGNIET QPRTIEKDLS PISITQPKNR SPVYEPLLSD SPNATRRSFG PGTPFEFFQS QSRLSSSSGY 1101: TRNCKDN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)